(Richard de Cauwer/iNaturalist/CC BY-NC 4.0) Comprendre les origines de la virus provoquant COVID-19 [feminine] est l'une des questions clés que les scientifiques tentent de résoudre tout en travaillant sur la façon de gérer le pandémie . Mais dans une situation qui évolue rapidement, nous sommes obligés de pointer du doigt quelques suspects innocents en cours de route.
L'hypothèse actuelle va quelque chose comme ceci: SRAS-CoV-2 traversé un hôte animal mystérieux dans son voyage évolutif présumé des chauves-souris aux humains. Les pangolins en danger critique d'extinction ont été un candidat privilégié pour cettehébergeur intermédiaire, mais maintenant une analyse génomique menée par le généticien Ping Liu de l'Académie des sciences du Guangdong en Chine a fourni la preuve que ce n'est peut-être pas le cas.
Le SRAS-CoV-2 appartient à la Bêtacoronavirus genre de coronavirus; ce groupe de coronavirus infecte principalement les mammifères, et la nouvelle étude suggère que les pangolins sont en effet des hôtes naturels pour eux.
L'équipe a reconstitué presque tout le génome des coronavirus trouvés chez deux malades Pangolins malais ( Javanica douce ). Ils ont appelé le coronavirus isolé de ces animaux en danger critique d'extinction pangolin-CoV-2020. Sa séquence finale comportait 29 521 paires de bases, à peine plus courtes que les quelque 30 000 paires de bases composant le SARS-CoV-2.
Le génome résultant a affiché une similarité de séquence de 90,32 % avec le SRAS-CoV-2 et de 90,24 % avec le Relatif à Rhinolophus chauve-souris coronavirus BatCoV-RaTG13, qui reste toujours lele plus proche connu par rapport au SRAS-CoV-2, avec une correspondance de 96,18 %.
Mais les similitudes de séquence ne reflètent pas toute l'histoire. Les instructions génétiques pour le tout importantpic protéique du virus SARS-CoV-2correspondait plus entre la chauve-souris et le coronavirus humain que le pangolin.
Cependant, le virus du pangolin partage essentiellement le mêmeRécepteur de liaison ACE2comme celui utilisé par le virus COVID-19 - la partie de la pointe qui permet au virus d'entrer et d'infecter les cellules humaines. Cela a également été trouvé dans une autre étude qui est toujours en cours d'examen, etconduit à des suggestionsque le coronavirus humain pourrait être un type d'hybride (une chimère) entre une chauve-souris et un virus du pangolin.
L'équipe de Liu pense également que ces similitudes peuvent indiquer qu'un événement de recombinaison s'est produit quelque part dans l'évolution de ces différents virus - où les génomes viraux ont échangé des morceaux de leur matériel génétique entre eux. Cependant, leur analyse de la relation évolutive entre les trois virus n'a pas soutenu l'idée que la version humaine a évolué directement à partir de celle du pangolin.
'Au niveau génomique, le SRAS-CoV-2 était également génétiquement plus proche du Bat-CoV-RaTG13 que du pangolin-CoV-2020', ils ont écrit dans leur papier.
Il y a clairement encore beaucoup d'inconnues. Avec bien plus de 4 millions de cas confirmés dans le monde, et un nombre de morts toujours en forte augmentation, la nécessité d'en savoir le plus possible sur ce virus ne fait que s'intensifier.
Cependant, une chose que toutes ces études génétiques ontfermement excluest l'idée que lele virus a été fabriqué en laboratoire.
Quant aux pangolins, ils avaient été secourus par le Guangdong Wildlife Rescue Center après avoir été passés en contrebande pour le marché noir, et ont malheureusement succombé à leur maladie. L'équipe de Liu n'a pas pu déterminer si leur décès était lié au coronavirus qu'ils ont trouvé.
Mais peut-être qu'un peu de bien peut ressortir de tout cela, au moins pour lele plus trafiqué au mondemammifère, avec lechercheurs concluant:
'Minimiser les expositions des humains à la faune sera important pour réduire les risques de propagation des coronavirus des animaux sauvages aux humains.'
La nouvelle recherche a été publiée dans Pathogènes PLOS .